1966年6月6日，精灵世界与现实世界重叠，部分地方发生深层次交互，形成独特的区域，以至于两个世界的人类均可进入，但两个世界的人类却无法进出彼此所在世界。这种独特的区域被地球人类称之为秘境。随着时间的推移，精灵世界与现实世界重叠交互程度逐渐增加，全世界秘境数量也随之不断增加。本该出现的精灵动漫，因为精灵秘境的出现而转变成了另一种形式。2004年6月6日，从2024年重新回到2004年的萧澈，发现时间线从1966年开始便彻底走偏了。重回6岁的萧澈意外发现自己的卧室与神奇宝贝世界神奥地区的一个小女孩的房间发生了重叠交互。一个名叫希罗娜的小女孩彻底走进了萧澈的日常生活。